Представительный орган городского округа город Губкинский - Дума города Губкинского, состоит из 22 депутатов, избираемых на муниципальных выборах по 5 многомандатным округам сроком на 5 лет.
В сентябре 2021 года Председателем Городской Думы избрана Пескова Ольга Николаевна.
Глава городского округа город Губкинский (Глава города Губкинского) является высшим должностным лицом города Губкинского и наделяется собственными полномочиями по решению вопросов местного значения.
Глава города Губкинского избирается депутатами Думы города Губкинского из числа кандидатов, представленных конкурсной комиссией по результатам конкурса, возглавляет Администрацию города.
Срок полномочий - 5 лет.
В августе 2023 года Главой города Губкинского избран Бандурко Андрей Витальевич.
Основан 22 апреля 1986 года. Город расположен в двухстах километрах от Полярного круга в северо-восточной части Западно-Сибирской низменности в лесотундровой зоне на левом берегу реки Пяку-Пур. В 16 км находится станция Пурпе и железная дорога Тюмень-Сургут-Новый Уренгой.
В 1996 году он получил статус города окружного значения. Местное самоуправление на территории города осуществляется с декабря 1996 года.
В 2021 году муниципальное образование город Губкинский переименован в городской округ город Губкинский Ямало-Ненецкого автономного округа.
В 2021 году город Губкинский и поселок Пурпе, расположенный в границах Пуровского района, преобразованы путем присоединения поселка Пурпе к городу Губкинскому (Закон ЯНАО от 23.04.2021 N 34-ЗАО «Об изменении административно-территориального устройства Ямало-Ненецкого автономного округа путем преобразования населенных пунктов в форме присоединения, об организации местного самоуправления на территории городского округа город Губкинский Ямало-Ненецкого автономного округа и изменении его границ» и Закон ЯНАО от 23.04.2021 N 35-ЗАО «О внесении изменений в Закон Ямало-Ненецкого автономного округа «О преобразовании муниципальных образований, входящих в состав муниципального образования Пуровский район, и создании вновь образованного муниципального образования муниципальный округ Пуровский район Ямало-Ненецкого автономного округа» в связи с изменением границ»).