Представительный орган муниципального округа Красноселькупский район - Дума Красноселькупского района, состоит из 10 депутатов, избираемых на муниципальных выборах по мажоритарной избирательной системе относительного большинства по трём многомандатным избирательным округам.
Срок полномочий Думы Красноселькупского района - 5 лет.
В сентябре 2021 года Председателем Думы избрана Титова Ольга Геннадьевна.
Глава Красноселькупского района является высшим должностным лицом муниципального образования, наделенным собственными полномочиями по решению вопросов местного значения.
Глава Красноселькупского района возглавляет Администрацию района.
Глава Красноселькупского района избирается Думой Красноселькупского района из числа кандидатов, представленных конкурсной комиссией по результатам конкурса. Срок полномочий - 5 лет.
В ноябре 2021 годя Главой Красноселькупского района избран Фишер Юрий Владимирович.
Административным центром муниципального округа Красноселькупский район является село Красноселькуп.
Красноселькупский район образован Указом Президиума Верховного Совета Российской Советской Федеративной Социалистической Республики 10 августа 1944 года, в состав которого вошли территории Верхнетазовского, Тазовско - Ненецкого, Тазовско - Селькупского и Тымско - Караконского кочевых советов, ранее входивших в состав Туруханского района Красноярского края.
Решением Тюменского облисполкома от 16 мая 1957 года Тазовско - Ненецкий сельсовет переименован в Сидоровский, Тазовско - Селькупский сельсовет - в Толькинский и Тымско - Караконский - в Красноселькупский.
Местное самоуправление осуществляется с ноября 1996 года.